Genbank上的Anoles

随着最近 的顺序 Carolinensis genome and 汤姆’s recent post 关于其他物种的资源,我想知道有多少DNA序列可用于肛门?为了回答这个问题,我从 Anolis 和其他属现在被认为是 Anolis (Norops,Chamaeleolis,Chamaelinorops, 霸王龙)在NCBI上’s popular GenBank 数据库。我找到 Genbank‘的核苷酸数据库包含29个以上的独特anole序列。毫不奇怪,最多的序列(25,973)来自 卡罗林。其余序列分为216种Anole物种。卡罗来纳州之后的顶级物种是: 克鲁吉 (433), Distichus (378), 萨格里 (351)和 cristatellus (328)。其他人会对这些总数感到惊讶吗?我会猜到的 萨格里 将是第二。我认为 A.distichus 在未来几年内至少会翻番,部分是因为我’我本人从这个物种上做了很多测序。

仅有10种以上的序列代表29种,而GenBank中的216种则有一半由单个(通常是线粒体)序列代表。这些数据的可用性凸显了我们在其余的其余的阳极多样性中提出进化和生态问题的前景,同时也凸显了如果我们有兴趣进行广泛的属类比较,那么未来的工作量很大。诚然,Genebank落后于当前的研究,因为我们大多数人仅在发表时发布序列(在未来几年中,我们将添加数百个序列)。

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1 Comment

  1. I’我很惊讶克鲁格比萨格里人更早。我也可能已经猜到,除了A. carolinensis以外的其他大陆物种也会被列入名单。

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