Author: Luke Mahler

上个星期， 我写了一篇文章 关于如何提出新的肛门分类 Nicholson等。 2012年 可能会影响该组的长期生物分类稳定性。该帖子产生了 一些讨论，包括最近的Kirsten Nicholson本人的评论，解释了她的小组认为是时候拆分肛门的一些原因。由于该对话很快就被Anole Annals所深深掩盖，因此我想在主页上继续进行下去。另外，我想写些其他内容，以扩展上周促使我发表的一些想法，并希望人们继续参与进来（请注意，如果您初读该文章的其余部分，将会更加有意义。 我以前的帖子，随后 评论）。我想提出几点要点：

1 –我想我们都同意分类法应该反映准确的系统发育知识（我认为这里没有人会不同意–假设Linnean分类群不应是共生或多系的）。

2 –除准确性外，我很确定没有任何规则可以控制“应”包含在二项式分类中的系统发育信息的类型或水平。二项式名称应反映深层系统发育知识还是浅层系统发育知识是一个意见问题–我认为这完全是主观的。

3 –在二项式分类中可以传达的系统发育信息量微不足道。很难在整个Linnean层次的整个深度上表示系统发育结构，并且Genus + species名词中几乎没有此类信息。在处理属名时（只要它们在系统发育上不准确），传达精细解析的系统发育信息的目标可能不应该成为我们的主要关注点。

4 –鉴于没有人说出一个属的正确系统发育尺度是谁，而且拉丁二项式方法无论如何都无法传达许多有关系统发育信息的信息，因此稳定性问题相对非常重要。为成千上万的人研究的一组物种的科学名称中的88.6％（n = 343）提出一项更改并不是一件容易的事。

既然我认为我们都可以同意Linnean名称应仅用于一类群体，那么我将从第二点开始，即没有“适量”的系统发育知识应以二项式名称表示。 克尔斯滕建议 我们可能都同意“我们的分类应该反映我们的系统发育知识”。我当然同意这一说法，但我怀疑我可能在某些细节上不同意。确切地讲，哪种分类最能反映我们的知识？我们是否应该将属分配给我们可以合理确定的单系的最小系统发生单元，并在努力解决整个肛门的分叉历史的过程中继续将它们划分为其他属？如果是这样，我们最终可能会得到与非禽类恐龙一样精细的分类法，在该分类法中，属：种比率为1：2（我甚至不是在开玩笑– 看看这个…）！在这一点上，我们将有各种各样很酷的二项式 尼古罗尼丝无花果 和 毛，但属在功能上等同于物种名称（就像它们在恐龙中一样）。 Nicholson论文的标题中暗含了这种推理（分类学应该反映出不断完善的系统发育知识），这似乎暗示着，当系统学的进展足够快时，定期地对所有事物进行重新分类是“时候了”（我认为这与Linnean分类的创立宗旨相矛盾，但这是另一点。无论如何，如果这不是分类学反映系统发育知识的含义，那到底是什么意思？为什么是8属，而不是60、16或4？

我的主要观点是，拉丁文名称应属于哪种系统发育知识。一个人可能认为属应适用于MRCA，并且任何两个物种的所有后代都应相似，足以被经验丰富的爬行动物学家弄糊涂（例如， 番荔枝 和 双孢曲霉;有关详细信息，请参见Williams 1966）。另一个人可能会坚持一个属最多应有20种，没有例外。两者都完全是观点问题，而就系统论而言，这种观点比比皆是。但是，由于没有关于此事的官方指南，我认为这样的观点不足以证明具有破坏性的分类学改变。

接下来，我想批评修改属名以反映系统发展的逻辑。原因是（a）拉丁二项式中的系统发育信息很少，并且（b）属名的任何变化都将导致获得一些系统发育信息（较浅的信息），而以其他系统发育信息为代价（较深的信息）东东）。

Linnean二项式几乎不包含任何系统发育信息。当我们查看一系列科学名称时，我们所知道的是，同族之间彼此之间的联系比与其他属成员之间的联系更紧密，除此之外，他们没有告诉我们任何有关系统发育的信息。为了说明这一点，我为鬣蜥科（或鬣蜥，取决于您跟随的人）创建了“二项式系统发育树”。我将“ 爬行动物数据库。这里’传统分类的样子 Anolis highlighted in red:

二项式“phylogenetic tree”按照传统分类对鬣蜥属进行分类。

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从最近Anole Annals的几篇帖子和评论中可以明显看出，Nicholson及其同事上周发表了一篇论文，建议“现在是时候对新的肛门进行分类了。” Among a 参数数量 赞成拆分属 Anolis，Nicholson等。 （2012）认为，使用单一属名称阻碍了有关这些动物的科学交流。这个论点引起了很多讨论（例如， Sanger发表，并找到两个不同的评论线程 这里 和 这里），我认为继续讨论可能会有所帮助，其中提供了一些有关科学文献中有关Anole名称用法的信息。

在一个 评论 在之前的一篇文章中，杜尔曼（Duellman）指出，不仅仅存在一个属名称以反映系统知识 – it’一个（希望稳定的）句柄，可以将有关身份的信息传达给非常广泛的受众，从非专业人士到大学生再到生态学家，保护主义者和系统主义者。我的印象一直是，对于 Anolis –对于其他许多生物体，则更多。例如，壁虎以其俗名甚至是科学家都广为人知“gecko,”我们在论文标题和摘要中找到了这个术语。我不’认为这对肛门是真的–在我看来，我们通常更简单地称呼他们“Anolis“.

为了确定是否确实如此，我决定从中提取一些数字 知识网。我进行了一系列“Topic”搜索各种分类名称，例如“Anole”, “Anolis“, “Gecko”等等，并记录每次搜索的匹配记录数。记录包括在Web of Knowledge学术数据库中记录的任何书籍或文章的标题，关键字或摘要中找到术语的实例。返回的数字反映了我的大学’的图书馆馆藏（加利福尼亚大学），如果在其他地方进行则有所不同；我也没有’不花时间处理结果，但是我不’认为应该从质上影响任何结果。

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**更新（2012年7月17日）：感谢所有贡献文学的人– it’s a huge help! We’在实现获取以下内容的所有原始说明的第一个目标方面，我们已经取得了良好的进展 Anolis species. Here’s an updated “最想要的清单.” We’非常接近将他们淘汰….

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安诺尔 bibliophiles and reference collectors,

的安诺琳·蜥蜴专家组 有一个问题要问，一个也要返回：我们需要您的帮助来组装一个数字参考图书馆 Anolis literature.

我们的目标？–汇编所有与生物分类或保护相关的文献的PDF文件 Anolis lizards.

的reason we’重新这样做是为了帮助 IUCN红色名录 肛门评估过程。随时可以获取这些文献，大大简化了进行和审查物种评估的任务。另外，作为自然保护联盟’s “Red List Authority” for Anolis 蜥蜴，ALSG将很快维护目前公认的Anole物种的权威列表。方便地获取anole分类学文献也将促进这一点。

我们已经开始了这个过程，我们’产生了良好的效果。像你们许多人一样，我们’多年来一直积累anole PDF（尽管有时是偶然的）。我们最近

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