Author: Yoel Stuart 第1页,共6页

我对生态学是否,如何以及为什么会随着时间影响进化(以及进化会影响生态)感兴趣,重点是微观进化模式和过程,适应性和田间实验。我完成了博士学位哈佛大学生物与进化生物学系的Anolis蜥蜴研究。我目前是德克萨斯大学奥斯汀分校的博士后研究员,研究Threespine Stickleback。他们不是肛门,但他们也很酷。

从福尔马林保存的标本中进行DNA测序

jars.2It’福尔马林保存的样品可以’不能对DNA进行测序,因为福尔马林会降解DNA而无法使用。然而, 最近一篇论文 出现在 基因组研究 描述了福尔马林制备的样品的成功全基因组测序。

如果可以对福尔马林固定标本中的DNA进行测序,那么就可以通过博物馆标本在时空上进行遗传研究。

但是, 基因组研究 纸,除了被福尔马林固定之外,还被石蜡包​​埋,并且可能被深度冷冻,因为它们是癌症研究的档案样本。对于福尔马林固定样品的成功测序,可能还需要石蜡包埋和深度冷冻。因此,也许该方法赢得了’不能用于在室温下保存75年的样品。

我不’没有专业知识要说。我们是否有更精通分子的读者愿意冒险?

如果遗留了任何DNA,例如经过短暂的福尔马林固定后再用乙醇储存,那么福尔马林保存的样品的DNA测序应该相当于古老的DNA方法,对吗?

引用:Scheinin,Ilari等。 2014。通过浅层全基因组测序对新鲜和福尔马林固定的标本进行DNA拷贝数分析,鉴定并排除基因组装配中存在问题的区域。 基因组研究 24:2022-2032。 doi:10.1101 / gr.175141.1

Sans the Claws,Anoles Present Of The Trees?

屏幕截图2014年12月3日下午12.14.31首先 Anole年鉴饰演Anthony Geneva 提醒我们 几天前 AA’s 五周年纪念日,由一些与anole相关的hai句组成。其中之一是:

露珠和脚趾板。
自适应辐射。
关键创新?

关键创新是被认为可以使血统极大地多样化的特征,因为这些特征是适应性技术,可以消除限制并允许血统进入新的生态位和适应区。在anoles中,去皮被认为是一项关键的创新,因为它为信号的性状提供了更大的多样性,这些性状对于伴侣和双色球开奖结果双今天开奖号码的识别很重要,从而提高了双色球开奖结果双今天开奖号码间的形成率  Anolis。*

脚趾板也被认为是一项关键创新。脚趾板可让小脚趾爬在光滑的表面上。通过攀爬,Anole双色球开奖结果双今天开奖号码不仅可以在水平空间中划分栖息地,而且可以在垂直空间中划分栖息地。因此,脚趾板将树木的利基向肛门开放,从而可能在脚趾甲中发挥作用。 Anolis 适应性辐射期间的社区聚集。

几条证据支持脚趾板’作为适应植物学的角色。 (1)在树冠较高的那些茴香双色球开奖结果双今天开奖号码上确实发现了较大的脚趾垫; (2)较大的脚趾垫具有更好的附着力; (3)最近的一项研究表明, 卡罗林 转向更高的栖息地后迅速演变成更大的脚趾。

但是,肛门也有爪子。

屏幕快照2014-12-03 at 12.13.16 PM谁知道猫跳过头顶的人都知道,爪子对于爬山也很有用。爪子可以通过与表面的凹凸不平互锁或通过摩擦来与表面相互作用,并且爪子的形态在一定程度上决定了其对爬坡的作用。很少有研究 Anolis 爪,但是,我们不’对于在攀爬过程中是否以及如何使用爪子有很好的认识。我们也不要’不知道爪会如何与脚趾垫一起进化。因此,爪在肛门发育中的作用及其与植物的关系仍然未知。

为此,C兰德尔 等。调查爪子(和脚趾板) 在一份刚发表的新论文中 动物学。他们发现脚趾板没有’讲述了整个故事 Anolis 攀登。也许, 爪还可以确定 Anolis 必须留在地面上并且可以进入树木。继续阅读…

出该死的点!或者,他们如何’d如果他们怀有爱意’t Fighting

喂那'不是一个anole! Rubyspot豆娘(美洲虎)版权所有Steve Collins

喂那’不是一个anole!美国红宝石豆娘(Hetaerina americana)。史蒂夫·柯林斯(Steve Collins)版权所有

我和我的同事最近发表了一篇 纸质文字位移Carolinensis 在入侵之后 萨格雷 进入佛罗里达。前者移到树上,并进化出更大的脚趾。我们在该论文中做了很多工作,以高度确定性地表明这两个双色球开奖结果双今天开奖号码之间的相互作用是导致汉字字符移位的原因。 卡罗林。但是,关于它们共享什么样的交互,仍然存在一个悬而未决的问题。这两个双色球开奖结果双今天开奖号码极有可能争夺食物(即剥削性竞争)。它们也可能通过共享的捕食者或寄生虫间接相互作用(即明显的竞争),并且众所周知彼此会吃东西’s的孵化(即公会内捕食)。

今天我’d希望深入探讨另一种可能的相互作用:也许这两个双色球开奖结果双今天开奖号码在减少空间和领土侵略性种间相互作用方面有所分歧(即干扰竞争)。要了解更多,’转到Odonata世界的anoles(我知道这是挑衅性的说法!):rubyspot damselflies( 海藻)。

在最近一期的 皇家学会学报B, 乔纳森·德鲁里格雷格·格雷瑟(Greg Grether) 研究了侵略性(或激动性)相互作用在驱使两种红宝石豆娘之间发散的作用。

之前的工作 [1,2,3]在格雷瑟’研究小组表明,在红点娘娘鱼中,雄性竞争者的识别取决于后翅的着色,而同一地区双色球开奖结果双今天开奖号码之间的跨双色球开奖结果双今天开奖号码识别和雄性翼的着色是不同的。这表明,不同双色球开奖结果双今天开奖号码的雄性之间的侵略性相互作用促使机翼颜色发散,从而降低了双色球开奖结果双今天开奖号码之间能量密集的侵略性相互作用的频率。这种差异与一种称为“非角色性位移”(ACD)的字符位移类型一致,这是某种形式的双色球开奖结果双今天开奖号码之间的差异。 种类 识别特征,以减少攻击性aggressive碰的负面影响。

但是,另一种字符替换,即生殖字符替换(RCD)也与这些先前的发现相一致。 RCD是发散的,通常在某种程度上 伴侣 两个双色球开奖结果双今天开奖号码之间的识别特征。通过改变这种性状(想想小茴香的去皮),不同双色球开奖结果双今天开奖号码的雄性和雌性就不太可能花费宝贵的时间求爱或交配,进行浪费性的,失败的跨双色球开奖结果双今天开奖号码生殖工作。

至此,您,精明的读者,可能已经注意到ACD和RCD都可以预测信号特征的变化–前者是双色球开奖结果双今天开奖号码识别特征,后者是伴侣识别特征。

每当同一性状作为双色球开奖结果双今天开奖号码和伴侣识别的信号时, 确实经常发生,很难区分这两个截然不同的过程(即选择减少减少浪费的积极努力与选择减少减少浪费的生殖努力)的行动*。

Drury和Grether设计了一个很好的检验来成功区分这两个假设。

加勒比山高地:规模,海拔和收敛演化

在《美国自然主义者》最近的一篇论文中,MarthaMuñoz,Johanna Wegener和Adam Algar指出了两个有趣的格局,分别在古巴和伊斯帕尼奥拉上进化出的两个加勒比小岛:高海拔双色球开奖结果双今天开奖号码的体型通常比低海拔双色球开奖结果双今天开奖号码的体型更小*。

身体大小-西班牙裔(cybotes进化枝)和古巴(sagrei进化枝)肛门的高程关系。 x轴是高程(在对数刻度上)。颜色代表每个进化枝中的单个双色球开奖结果双今天开奖号码。

图1:西班牙裔(cybotes进化枝)和古巴(sagrei进化枝)肛门的体型与身高的关系。 x轴是以米为单位的标高(在对数刻度上)。 y轴是SVL(即喷口长度),它是大小的度量。颜色代表每个进化枝中的单个双色球开奖结果双今天开奖号码。灰色代表 拟南芥 和A. sagrei分别位于西班牙裔和古巴。

发现这两组人以相似的进化模式独立收敛后,作者想知道:潜在的进化进程是否也相同?

为了回答这个问题,作者利用了两个进化枝包含多个双色球开奖结果双今天开奖号码这一事实。通过测量每个双色球开奖结果双今天开奖号码内的体重增加模式,然后询问这些模式与种间模式如何结合,以创建在所有双色球开奖结果双今天开奖号码中观察到的总体身体大小升高系(SEC),Muñoz&Co.可以辨别进化枝趋向融合的进化枝之间的细微差异。例如,一个进化枝可能通过在每个双色球开奖结果双今天开奖号码中存在相同的SEC关系来建立其整体大小-升高系,而双色球开奖结果双今天开奖号码也按海拔和大小进行分类(模型H1)。而另一个进化枝可能只是通过种间大小和高度的种间差异而建立其大小升高系,而在双色球开奖结果双今天开奖号码内部却没有SEC关系(模型H2)。

图2:作者提出的八个模型中的两个模型,这些模型可以解释身高升高氏族如何进化。种内种系由不同的彩色/虚线表示。通过绘制每种双色球开奖结果双今天开奖号码的平均大小和海拔高度的假想线,可以最好地显示跨双色球开奖结果双今天开奖号码的种系。在H1中,每个双色球开奖结果双今天开奖号码具有相同的大小-高度关系(即负斜率),并且位于不同的海拔高度。这将创建一个依赖于种内和种间模式的尺寸-高度关系。在H2中,每个双色球开奖结果双今天开奖号码都没有大小与海拔的关系(即平坦的坡度),但是在不同的海拔高度发现。在这里,尺寸-高度关系纯粹是由高度和尺寸之间的种间差异驱动的。

作者开发了八个模型,用于研究双色球开奖结果双今天开奖号码内和双色球开奖结果双今天开奖号码间的海拔和大小之间的关系。他们测试了这8个模型中的哪一个最能解释双色球开奖结果双今天开奖号码和进化枝内大小与海拔之间关系的变化,同时考虑了采集地点之间的空间自相关和双色球开奖结果双今天开奖号码之间海拔范围的差异。然后,他们比较了各个进化枝的最佳模型,以查看是否通过相似或不同的进化途径达到了收敛。

他们发现了什么?

现在的空格
图3:Hispaniola(左侧面板)和Cuba(右侧面板)的特定尺寸内高程线(SEC)。实线表示重要的SEC。虚线表示不重要的SEC。

在Hispaniola上,每个双色球开奖结果双今天开奖号码都倾向于不表现出任何明显的种内SEC关系:请注意图3左图中虚线的平坦斜率。相反,整个SEC的大部分来自大小和海拔高度的种间差异,与模型一致H2(图2)。

相反,在古巴,作者发现了一些重要的种内SEC关系。–图3右侧面板中的实线–但发现大小和高度之间的种间差异无法解释进化枝’整体SEC(图4)**。

该模型与古巴数据最一致。

该模型与古巴数据最一致。

因此,作者回答了他们的问题:“尽管逆大小直线的精确机制仍然未知,但很明显,它们是在古巴和西班牙裔美国人上以不同的方式构建的。”换句话说,两个进化枝显示出向小规模收敛的模式,但是它们沿着种内和种间进化的不同路线到达那里。它让我想起了Yogi Berra’在被问到他家的方向时的回应:“当您上路前叉时,赶快行动吧!”

 

引文:M.M。 Munoz,J.E。Wegener和A.C. Algar。 2014年。解开对体内大小线的种内和种间影响揭示了构建趋同模式的不同过程。 Anolis 蜥蜴。 美国博物学家 184: 636-646.

 

*此图案是从16开始测量的 Anolis 种类:在九 萨格里 进化枝(古巴)和七个 cybotes 进化枝(Hispaniola)。在高海拔地区发现小体型是Bergmann的反向期望’s rule. Bergmann’根据最初的设想,S规则规定,生活在较冷气候中的吸热双色球开奖结果双今天开奖号码应更大(或表面积/体积比更大),以保持热量。由于蜥蜴是放热的,所以人们会期望逆伯格曼。也许我们可以将反cline称为Nnamgerb’的规则?它确实具有一定的魅力,不是吗?

**我想知道作者是否会在评论部分加入。尺寸上升直线是什么意思’使用每个种群的平均大小和高度在古巴发现t(下图5),但是在忽略双色球开奖结果双今天开奖号码同一性时发现(上图1)?这是一个例子吗 辛普森’s paradox?

屏幕截图2014年11月4日下午5.24.59

 

在圣地亚哥晒黑的绿色Anoles

动物园管理员琥珀卡尼 发送了这些照片的可能 Anolins carolinensis。  4月19日下午3点,在加利福尼亚州圣地亚哥的巴尔博亚公园发现了蜥蜴。他们’ve been reported in 洛杉矶 但是,尽我所能和乔纳森·洛索斯(Jonathan Losos)’的知识,从来没有在圣地亚哥。有没有其他人在圣地亚哥观察到野生的肛门?范围扩大!

在我看来,这就像是女性。

在我看来,这就像是女性。

男性,如果我不得不猜的话。

也许是男性。

牙买加:当天的加勒比海赫比托法纳岛

牙买加

如果你’像我一样,当你听到这个词时,你想到的第一张图片 牙买加 是一个系统发育树,显示了六种的单系辐射 Anolis 代表四种生态型和一种独特的双色球开奖结果双今天开奖号码。

那个’不是您的想法?

 

香菇,一位美女!

香菇,一位美女!

牙买加的肛门: 阅读所有关于它们的信息!
1) 茄子 是王冠,尽管它’如果您问我,那是小问题。
2) 香菇 是一个树干冠,是最漂亮的肛门之一。
3) 线虫 是一种树干状的大茴香,带有令人惊叹的奶油色露珠。
4) 乳脂栗 是在蓝山咖啡林中发现的一个很小的树干冠。
5) 孔雀 是一个独特的anole–对此知之甚少(但是看)。
6) 瓦洛诺氏菌 是一个小树枝anole,大且高密度。
7)(是的, 萨格雷 在那儿,但是’是在历史上从古巴入侵的。)

和往常一样,签出 加勒比人 以获得完整的清单 牙买加的疱疹 and the Caribbean!

你的爬行动物会让你生病吗?

Photo from:http://www.panoramio.com/photo/73496249 ?

http://www.panoramio.com/photo/73496240

埃博拉,流行性感冒,SARS和狂犬病等疾病有什么共同点?好吧,一个,他们’所有病毒。其次,更贴近这一讨论,他们’re all zoonoses–通常藏在非人类动物宿主中但偶尔扩散到人类的疾病。人畜共患病是大卫·夸曼(David Quammen)的主题’是一本非常出色的新书, 外溢.

http://www.realscience.us/2012/07/30/ebola-virus-spreads-across-uganda/

http://www.realscience.us/2012/07/30/ebola-virus-spreads-across-uganda/

Quammen与 外溢:他追踪了这些疾病,并进行了研究,研究人员从荷兰的山羊场,乌干达的蝙蝠洞到香港附近中国大陆的野菜市场进行研究。这本书读起来像惊悚片–埃博拉潜伏在哪里?– but doesn’不需要虚构的情节转折来保持页面的翻转。华门’对流行病学,生态学和人畜共患疾病的演变的准确,清晰和不完整的描述使页面转向相反。

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/50/Lesser_short-nosed_fruit_bat_(Cynopterus_brachyotis).jpg

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/50/Lesser_short-nosed_fruit_bat_(Cynopterus_brachyotis).jpg

的核心信息 外溢 is that a “successful”人畜共患病是机会的结果。就是说,许多人畜共患病原体的生活史并不需要穿越人口。它们将在动物宿主中生存,繁殖和传播。但是,如果人畜共患病恰好在人体中发现,可以生存的那些病毒(或细菌,原生动物等)将生存,繁殖并可能传播给其他人。因此,人畜共患病的故事是人类通过与动物宿主接触创造溢出机会的故事。例如,HIV(人类免疫缺陷病毒)与SIV(猿猴免疫缺陷病毒)密切相关,所有证据表明,它是通过使用黑猩猩作为食物而传播到人类的。尼帕(Nipah)是马来西亚,新加坡和孟加拉国的神经和呼吸系统疾病,很可能通过与果蝠粪便接触而扩散到人口中,随着人类城市,城镇和农业地区侵占热带雨林,这种接触正变得越来越普遍。蝙蝠打电话回家。总之,与野生动物的密切接触大大增加了溢出的机会。

与野生动物紧密接触… Close contact…嗯,我们又要做什么?…

IMG_9314复制

Photo from: http://www.ahailey.f9.co.uk/appliedherpetology/cariherp.htm

photo from: http://chipojo.webnode.cz/fotogalerie/#! 百里香

 

 

 

 

 

亚历克西斯·哈里森(Alexis Harrison)摄影。

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无头巴拿马anole

 

 

 

 

哦耶… Uh oh! 

蒙特塞拉特:加勒比海赫比托法纳岛的一天

酸蝶(Anolis lividus)。乔纳森·洛索斯(Jonathan Losos)摄

酸蝶(Anolis lividus)。乔纳森·洛索斯(Jonathan Losos)摄

蒙特塞拉特(Montserrat)位于小安的列斯群岛小岛链的北端,这里有许多 有趣的疱疹, 包括地方性鸡 蒙彼塞拉蒂,地方性石龙子 马布亚蒙特塞拉泰和地方性的anole Anolis 天生的。这个Anole非常勇敢 已调查报告 通过 Anole年鉴’ 强悍的考古学家玛莎·穆诺兹(Martha Munoz)。如果您询问我使用的理由“bravely” and “intrepid”让您有点迷茫,蒙特塞拉特从活跃火山喷出的烟雾将带您进入答案:苏弗里耶山丘穹顶坍塌并喷出火山灰时,玛莎在岛上 向天空9英里!

灰云

圆顶的坍塌使灰烬飞向天空。 2010年1月。摄影:Martha Munoz。

从太空看

从太空看。图片来自NASA。

格林纳丁斯:当天的加勒比海Herpetofauna群岛

The Grenadines. (http://en.wikipedia.org/wiki/File:Grenadines- Archipelago)

The Grenadines. (http://en.wikipedia.org/wiki/File:Grenadines- Archipelago)

看看 格林纳丁斯,在小安的列斯群岛的南端发现了大约600个岛屿的多系链。马提尼克海峡以北的岛屿由 圣文森特。马提尼克海峡以南的岛屿由 格林纳达。 (格林纳达,你’ll recall, was 被美国入侵 in 1983).

鉴于马提尼克岛频道’作为政治边界的明显角色,我想知道它是否也是重要的生物地理边界,就像 华莱士’s Line 在印度尼西亚。华莱士’s线,该线穿过龙目岛海峡之间的 里岛龙目岛和between 婆罗洲苏拉威西岛,表示亚洲和海洋动物区系之间明显的动物区系断裂。生物地理学的解释是华莱士’s线遵循从大陆架到深水航道的过渡,这是迁移的障碍。

马提尼克岛频道(添加行)。

马提尼克岛频道(添加行)。

看看加勒比人 格林纳丁斯发现的Herpetofauna分布 这表明马提尼克岛海峡实际上并不是生物地理学的突破。在格林纳丁斯发现的大多数疱疹的分布穿过该通道,这表明该通道不是迁移的障碍。而且,与此相一致,Google Earth建议该频道不是很深。

哦,差点忘了: Anolis 格林纳丁斯种是 A. aeneus,A。richardi, 和侵入性 A.萨格里。

Anolis aeneus. Photo from http://www.kingsnake.com/westindian/anolisaeneus5.JPG.

Anolis aeneus. Photo from http://www.kingsnake.com/westindian/anolisaeneus5.JPG.

Anolis richardi. (Photo from http://reptile-database.reptarium.cz)

Anolis richardi. (Photo from http://reptile-database.reptarium.cz)

开曼群岛:当日加勒比海赫比托法纳岛

今天’每日岛屿实际上是由三个岛屿组成的集合 开曼群岛: 小开曼岛, 大开曼岛开曼布拉克.

小开曼岛是一个安静的小潜水社区,居民不到100名,主要由外国人和经营旅馆的人组成,这些旅馆接待着加勒比海最好的潜水和浮潜所吸引的游客。当我在那里时,我们遇到了一些当地人,他们带我们参观了小岛,然后乘车约20分钟绕小开曼岛航行。我们看到了濒临灭绝的动物 开曼环藻 在岛的北侧,在一个聚集游客的地方。据,直到...为止 Anolis 去,小开曼有 马纳里斯(Anolis maynardi),非常 long-snouted 绿色的Anole。他们还有一个红透的人口 Angres sagrei Jason Kolbe展示的内容与 萨格雷 在古巴比他们在赤身裸体的人群 萨格雷 在大开曼岛上。

大开曼岛的西部分支,最大的岛屿,感觉有点像迈阿密的南海滩,那里有昂贵的度假酒店,精品店购物,还有摇摆的海滩和夜生活场所。往东走,您会发现喀斯特地貌之中生长着经典的加勒比干林。濒临灭绝的大开曼岛蓝鬣蜥, 刘易斯,在该岛东端的植物园内及周围有大量人口。这个双色球开奖结果双今天开奖号码不是蓝色的 虎杖 但是根据光线的照射方式,它确实会呈现出蓝绿色的光泽。

大开曼岛蓝鬣蜥
(照片来自维基百科页面)

香蒜 在大开曼岛值得注意– it is related to 葛拉哈米 来自牙买加,但发展了 美丽的紫蓝色露珠,与 葛拉哈米’s 黄色的露珠。

开曼布拉克(Cayman Brac)感觉像小开曼岛(Little Cayman),除了它更大,人口中心很少而且虚张声势之外,虚张声势从西部的虚无逐渐发展成东部150英尺的高耸。在飓风期间,居住在开曼布拉克(Cayman Brac)上的人们曾经爬上山并躲藏在编织成虚张声势的山洞中。我们花了一些时间在Brac上寻找 cryptic invasion of Angres sagrei萨格里流行 Angres sagrei luteosignifer 人口。该项目正在实验室中进行。在那工作很有趣,我们遇到了很多友好的人。

有关开曼疱疹的更多信息,请查看: CaribHerp.org.

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供电 WordPress的 & 主题作者 安德斯·诺én